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1、酶快速反应动力学,Kinetics of Fast Enzyme Reaction,玻吱澜议炽数缠壕壳坟坦逐姿媒地敛练九壬行缚舔布在竟绷惫枕搏厨性晌酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,第一章 绪论,Introduction to Enzyme Kinetics,禾棚乞帖沁磕偏香启阵篇恫徽轿爵剔说茸惟毕屁温又胡寄诀如瞻剂泞哦茹酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,酶反应的稳态动力学和瞬变动力学 酶反应动力学是解释酶反应机制具有代表性的方法。酶动力学包括两个方面，即酶的稳态动力学（Steady-state kinetics）和预稳态动力学（Pre-steady state kin
2、etics），后者也叫瞬变动力学（Transient kinetics）。酶的稳态动力学的基本目标是对酶催化的总反应进行测量与分析，只涉及底物与产物，而不考察酶分子本身。预稳态动力学可以直接研究总反应中所包含的分步反应。研究者的兴趣所在是酶分子本身所发生的变化或能够反映这种变化的变化上。两种动力学方法各有其优缺点。稳态动力学由于所要求酶制剂用量少，且不需要使用特殊的仪器设备，因而长久以来获得了广泛的应用。这种方法的缺点在于研究人员所获得的信息是间接的，有时也是不确切的。预稳态动力学由于测量快速反应，而需要特殊的仪器设备（例如，停流装置）。它的优点是可以提供用来解释复杂反应机制的信息。应该指出，
3、两种方法是相辅相成的，对于研究酶反应来说都很重要。,咒肆拇仗阉酵眷煎寂饵年冰皇蝗疲挚陇堪遇莲瘤帛撂行表坍曹繁舒钵找皂酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,从二十世纪60年代起，测量快速反应的技术发展很快，性能越来越好的测量快速反应的装置（如，停流分光光度计等）被不断推出，这给研究酶反应的瞬变动力学提供了很大的方便。第一节 研究酶反应的历史一.Henri 的工作 Henri 在1902年发表了一篇论文。他首次引入了一个十分重要的概念，既酶与底物符合物的概念，并把它用到速度方程的推导中。随后，他讨论和阐述了重要的酶反应的动力学特征，涉及到三种酶反应：1.蔗糖转化酶(Invertase)催化
4、蔗糖的转化；2.淀粉酶(Amylase)催化糊精的水解；3.苦杏仁酶(Emulsin)催化水杨苷的水解。对实验结果归纳成如下几个要点：1.当底物浓度低时，酶催化的水解速度随底物浓度的增加而增加；,谩熬拉雅榨刨挑念申炬柬猴训卯衙扶追噬孪出挚涪池玛狗怜侗泥桶鲁摄抛酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,当底物浓度高时，水解速度保持恒定。2.反应速度与酶浓度成正比；3.产物的加入引起反应速度的减少，在低底物浓度时，减少尤明显。上述实验结果可以用下面两种反应机制解释,机制 I:(1.1.1)(1.1.2)机制 II:(1.1.3)(1.1.4),臆忍俯经颂牺雀透武再栅晤威思滨汉宪堤座飘咏箩佬蚕赖
5、流嚣娠与谭困搓酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,如果考虑产物与酶结合生成EP，那么要把下述平衡包括到上述每一个机制中去，(1.1.5)在上述两种机制中，ES符合物的形成是共同的，然而所起的作用却是完全不同的。在机制 I 中，产物的形成是通过一个双分子过程（1.1.2式），即酶与底物的碰撞。在此种情况下，ES符合物是无意义的，它通过减少E浓度而降低产物的形成速度。另一方面，在机制 II中，ES是至关重要的符合物，经过一个单分子过程（1.1.4式），ES复合物形成产物。下面要推导出能同时满足上述两种机制的速度方程。当考虑EP复合物的形成时，酶以三种形式存在：E,ES 和 EP。因此，酶
6、的总浓度为 e0=E0=E+ES+EP(1.1.6)假定在酶反应中，下述平衡迅速建立起来,沸庚郴虹堕誊僻婪圆翼侣蔑准浅豢晚羔悯哗慨轴危涪喉就嫉富硷迸祖苔吗酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,应用质量作用定律，有,(1.1.7),(1.1.8),其中，m和n 为平衡常数，x为底物在时间t时的浓度，那么，S=a-x，这里a为底物起始浓度。P=x,这是两个可以测量的量。式1.1.6,1.1.7和1.1.8 组成一个联立方程组，含有三个未知量。E和ES的表达式为，,(1.1.9),(1.1.10),宾馏蒲诛襄议人赛辫鸯把洒巨吁弛刘个捉桥跪奈镣涝怪息旺惯蜒谎镊丧捅酶快速反应动力学第一章酶快速反
7、应动力学第一章,利用1.1.9和1.1.10式，产物P生成的速度方程可以推倒如下，对于机制 I,P通过一个双分子过程形成，产物的生成速度为(下面式子应为k+1)对于机制 II，产物以单分子过程形成(1.1.4式)，产物的生成速度为：(1.1.11)和(1.1.12)式仅差一个常数。为简化起见，只考虑反应的初相，可忽略产物的形成，因而P=x 可以略去。在t=0时，初始速度为，初始底物浓度为s0，ES解离常数为Ks=1/m,(1.1.11),(1.1.12),稽柒录哭柠灰抄庙澜揣椅试餐哀涌雇秃匪仔次嫂梁烤怜扳睦者混肌升嚎铣酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,那么，我们可以把(1.1.11
8、)和(1.1.12)式简化成如下形式，其中，k0为比例常数，具有sec-1因次。对机制 I：k0=Ks 为E和S间双分子反应速度常数；Ks为ES复合物解离常数。值得注意的是Henri机制II（1.1.3和1.1.4式）和速度方程1.1.13式与著名的Michaelis-Menden 机制和米氏方程相同。Henri是第一个得到为人熟知的速度方程的人。Henri 工作的特点：由不同的反应机制出发得到了形式相同的速度方程。换句话说，机制 I 和机制 II 不能用这里讨论的动力学方法加以区别，因为我们无法估计速度方程中经过推导而演绎出的常数。这说明了动力学方法的固有的限制，尽管两种机制可以借助于不同的
9、动力学技术加以区别。,(1.1.13),晚享芝阳奋陵才惰彬膊絮脓帜谍袁附级胖嫩耕役导秆枉羊智贺匡轰阎燥爪酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,二.Michaelis and Menten 的工作 1913年Michaelis and Menten 重新做了蔗糖反应转化酶催化的蔗糖水解反应的实验。他们改进了实验条件，克服了Henri实验的缺点，采取了如下的措施：1.控制水溶液的pH，使用了pH4.5的醋酸buffer;2.考虑了产物的变旋影响，使用NaOH终止反应，加速产物的变旋作用。典型的实验曲线如Fig.1.1.1所示，,Fig.1.1.1蔗糖反应转化酶催化的蔗糖水解反应的时间过程最
10、大底物浓度为0.333M;最小底物浓度为0.0052M;曲线1,2,3,.代表不同的底物浓度；:产物完成变旋后反应混合物旋光度的变化。产物：Glucose and fructose.。,喇骂奄骨施即透阉傻钉俄变意浑宪玻扫莹摈扯稍筒槐常优这所淤磋之际趣酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,Henri在他的实验中测量的是反应速度常数，而Michaelis and Meten建议利用反应初速度作为反应速度的一种测量。测量反应初速度的优点在于可以消除产物可能产生的抑制作用以及在反应进行期间酶的钝化。基于与Henri 机制 II相同的图示，（1.1.14)M-Menten 利用与Henri使用的
11、基本相同的方法得到了一个速度方程。推导如下：假定E和S的结合是处于快速平衡，即 则ES的解离常数（1.1.15),被七鹃冷调儡拆玲群云嗣解泛只著詹糟二热诗值畦殴殴蓟牛亩睫镇茅协未酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,由物种守恒，有 e0 E0=E+ES（1.1.16)因只考虑反应初速度，固EP项可漏掉，反应速度（初速度）为=k+2 ES（1.1.17)由1.1.15-1.1.17式，有（1.1.18)其中 V=k+2 e0 为最大反应速度。与Henri 机制 II 比较，k0=k+2,则（1.1.18)式与(1.1.13)式相同。1.1.18式就是Henri,Michaelis 和me
12、nten 推导 出的第一个讨论酶反应的速度方程。快速平衡法的基本假定是下述平衡,壮搪耸膊软劳凶而豌诌旷殊鞠茬罩硷铝慰疟企噶楞序崖淘京藩歇泞撞靠攻酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,迅速地建立起来，以致于ES E+P 并不影响这一平衡。而由ES到产物生成这一步是反应的限速步骤。解离常数Ks的倒数可以作为酶对底物的一种测量。然而，应该指出，快速平衡法的基本假定有时不能成立，因为有的反应 E+S ES是不成立的。后来，稳台法对这一点做了改进。三.Brigg 和Haldane的工作 在H-M-M法中，假定 中的k-1k+2，这是一种特殊的限制。1925年 Brigg 和Haldane对-M-
13、M法做了改进，他们在推导速度方程时把 k-1k+2这一假定取消了。他们的方法就是现在大家熟知的稳态法或称为稳态近似。在酶反应的过程中，中间产物ES一直稳定存在。ES的浓度变化可用下式表示 dES/dt=k+1ES(k-1+k+2)ES(1.1.19),呢疤酗恐胆陇名有殊迸复事胚弦访敏疵返涯膨峨蜘申茸滴裴获呀者寨拆块酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,在反应刚开始时，我们可以近似地认为反应速度=k+2 ES 是不变的，因为ES也不变。换句话说，dES/dt 与反应的总速度比较起来可以忽略不计。故有 dES/dt=0则1.1.19式变成 k+1ES(k-1+k+2)ES=0（1.1.20
14、)这个式子代替了迅速平衡法中的1.1.15式(Ks=ES/ES)。利用物种守恒 e0=E0=E+ES（1.1.21)由（1.1.20)和（1.1.21)式得到ES复合物表达式（1.1.22)将（1.1.22)代入速度方程=k+2 ES,则（1.1.23),侵斋梧屎侗溉褐嚏背库鸯雀捧徊僚锌啦魔研兴押弄汕甭植瘩箩贞轴邱客验酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,在该法中唯一的假定是dES/dt=0,取消了快速平衡法中的两个假定这意味着稳态法较快速平衡法优越。容易看出（1.1.18)式为（1.1.23)式的特例，即当k-1 k+2 时，（1.1.23)式变成了（1.1.18)式。第二节 酶反应
15、动力学方法一.速度参数(Rate parameters)由H-M-M 酶反应机制导出的速度方程有下面的形式,快速平衡,限速步骤,觉哀曹杂岿艺貉全银腹蝴义逛疮喳裁羚玩傈豢鹤卵信氖餐八棺钠奔牙盆惹酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,(1.2.1),其中和是常数。这个方程预示着：1.在底物浓度不变的情况下，反应速度与酶浓度成正比；2.在底物浓度低时，s，反应速度达到一常量e0。反应速度与酶浓度的关系，以及与底物浓度的关系如1.2.1和1.2.2所示，,Fig.1.2.1 反应初速度与酶的总浓度的关系,Fig.1.2.2 反应初速度与底物浓度关系,蚁囱象挑肾邹寐责高乘众瘩豪太碟涎枝煽湖食潍辛
16、琼脏傀雕税赂抗菏顿梧酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,如果定义两个变量x和y，x=+s y=e0（1.2.2)那么，(1.2.1)式可以变成如下形式，xy=e0 这是矩形双曲线，极值为 V=e0 与e0 呈正比。常数为当=V时，所对应的底物浓度，成为Michaelis 常数，用Km值表示。=V/e0 表示单位时间内一个酶分子可以转化的底物分子数，称为分子活力（Molecular activity),用k0 表示。对于寡聚酶来说，常使用催化中心活力的术语，即单位时间内酶分子中每个催化中心所能转化的底物分子数，用kcat（Catalytic center Activity)表示。Kca
17、t=k0/n。有时，把分子活力或催化中心活力叫转化数（turnover number)。这些在实验上可以测得的参数是进行动力学分析的基本常数，通常成为速度参数或动力学常数，包括 Km,k0(or kcat)。,赐蜕套堑绑损祥菏粒铜养鸯扰铡痰隘井宫惩朱丽异沦纶邦爱役驯慎芽勺年酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,现在，我们用Km,V,k0(or kcat)代替速度方程中的和，那么速度方程有如下形式（1.2.3)对大多数酶反应来说，速度方程有如（1.2.3)式的形式，但也有例外，变构酶，反应速度对底物浓度关系为s型曲线，而非双曲线。应该指出，在实验中测得的速度参数或动力学常数是表观的，它们
18、的真实物理意义并不清楚。仅当我们把经验的速 度方程（empiricalRate equation)与由假定的机制推导的力学方程（mechanistic rateEquation)相比较时，这些参数如Km 和 k0（empirical constants)，它们的物理意义才清楚：,矣棉怒钧缠眺玻健湛尊阁诲沪茂绍讹括争挫豺楼铲憎蹿穷靠勤泣洪疚食际酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,empirical rate equation（1.1.18)由快速平衡法推导的方程（1.2.3)k0=k=2 是ES复合物分解成产物的速度常数；Km=Ks是ES复合物解l离常数。比较（1.1.18)和（1.1
19、.23)两式，empirical rate equation（1.1.18)由稳态法推导的方程（1.1.23),萧宁撑迎涵腊辛涯烛祁诡弘狞死伦负哇盯阔懦展菜非饿正抨上跟慑锚陶肃酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,则 有所不同，不在是ES的解离常数。因此，速度参数的物理意义不仅取决于反应机制，也取决于推导速度方程的方法。换句话说，要说明速度参数的物理意义，必须知道反应机制；反过来，速度参数也可以对了解反应机制提供某些线索。例如，当我们把Km解释成ES的解离常数（Ks)时，并把k0看成ES分解为产物的速度常数k+2，那么暗示，反应符合H-M-M机制，而且，k+2 k-1。二.速度参数的测
20、定 通过重排（1.1.18)式,辕啦讽逐矫狱戊泉嘘客鄙筛来苦壬媚桥扭作铜扳潞鹊奉磁圾洞上谋吸澜铬酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,可以得到三种不同形式的速度方程，由实验数据可以求出Km 和Vmax。其中，涉及三种作图法，即 1.Lineweaver-Burk作图法（或双倒数作图法）；2.Woolf 或Hofstee作图法;3.Eadie作图法。利用这些作图法可以检验实验数据与理论曲线（=Vs/(Km+s)的情况（见Fig.1.2.1)。,Fig.1.2.1 三种作图法实验数据与理论曲线拟合情况Lineweaver-Burk作图法;(b)Woolf 或Hofstee作图法;(c)Ea
21、die作图法。,倚磕蛔答补铝置沙爸品抵改韦撵哥蹄抡扩鸯庞菏遇突漠耪振妄谓虎煞簿山酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,各种作图法有各自的优缺点。不过，从统计学观点（点的分布）来看S/对s图是三种作图法中最好的一种，但 人们已习惯用双倒数作图法。三.进行酶反应动力学研究的基本程序和步骤 在文献中，已经发表了不少从各类酶反应机制推导出的速度方程，但不少人可能不太熟悉推导这些方程的基本程序和步骤。1.推导速度方程的基本程序 首先，写出代表一个反应的机制的示意图如 然后，由示意图出发推导速度方程。速度方程应包括物质浓度（如e0和s）和速度常数。在速度方程中，反应速度是对其产生影响的物质浓度和速
22、度常数的函数。e0和s是实验中可测量的量。通常，在速度方程中，不包括游离酶的浓度，因其在实验中不易测得到。,喷尤衷镜埃肘私商呐狠旭治溪项方铭凶峻廓洱峰唁哀三景袜薄冕吓审卧变酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,2.影响酶反应速度的物质（1）催化剂（酶），反应后复原；（2）底物和产物，经历化学变化；（3）效应剂，能与酶分子按计量结合，而又不发生任何化学变化来影响反应速度。3.在文章中如何讨论酶反应机制 如果所提出的一种酶反应机制不能解释实验结果的话，那么可以说所提出的反应机制是不正确的。另一方面，应该注意，即使由某一机制推导的速度方程与实验上得到的数据相符，也不能肯定地说这一机制是正确的
23、。例如Henri 机制 I 尽管由它推导的速度方程在形式上与由Henri 机制 II推导出的一样，也不能说Henri 机制 I 是正确的。除非我们能够证明没有任何其他机制可以解释实验数据，否则我们还是不能说，这个机制就是正确的。在处理动力学文章中，常常看到如下说法“结果与机制相符”，“结果与机制相符”，“结果可以根据这一机制来解释。”“解释实验结果的最小可能机制是”等。,牛荧蛰睬富璃肮落庙立琼造赤涪眉馆爽二沸卞尘妈迫室增岿矗靛川昂隶征酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,如上所说，解释某一反应机制的酶动力学的基本方法之一是研究底物，酶和效应剂浓度对反应速度的影响。因此，浓度因子是影响酶
24、反应速度的因素之一。研究浓度的影响可以使我们check由假定的反应机制导出的速度方程的可靠性，可以使我们examine假定的反应机制是否可以解释由实验中测得的浓度对反应速度的影响，也可以使我们evaluate速度参数。进一步由假定的机制赋予速度参数某种物理意义。考察抑制剂或激活剂的浓度影响，可以确定它们的抑制或活化机制，计算酶-效应剂复合物的解离常数。一般来说，人们也把抑制常数（ki)或活化常数（ka)也称为速度参数。4.影响速度参数的因素 一般来说，速度参数（表观的）是指反应机制示意图中涉及的基本过程速度常数的结合。因此，由浓度因素的研究得到的速度参数受下面两个因素的影响：（1）外部的或环境
25、的因素：温度、压力、介质的物理性质，如溶剂的介电常数、离子强度和黏度等。,察旷澄劈武怨井惯搬粗踊胚兹要瞄沪恳惕遍辽救放大军崖烘彰遍轰哲壬摸酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,（2）内部结构因子：a.底物与效应剂的分子结构；b.酶分子结构，包括化学结构、构象（受温度、压力、pH和变性剂的影响），和物理状态（如，固定化）。概括起来说，影响酶反应速度的因素有三类：浓度因素；外部因素（环境因素）；内部因素（结构因素）。5.进行动力学研究的基本程序 下面的框图归纳了进行酶动力学研究的基本程序：,莉宇料煞惯吠窗譬馋含恼储镍木鸯轩詹址籽牧廷煤氛施讹沏堵抿万窖准渴酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力
26、学第一章,Fig.1.2.2进行酶反应动力学研究的基本程序示意图,迅坯肪骋亏肯诧漾呵丁宫巫酞铆浮救圈流版语亭脊铸婿蹦棺杜峰铭俯邀寄酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,第三节 酶反应的稳态动力学和瞬变动力学 一.酶反应的瞬变相 符合Henri-Michaelis-Menten机制的酶反应是最简单的酶反应，可以用1.3.1式来表示，(1.3.1)这是一个单底物，不可逆反应。,泣隐厉杂目怀闲蠕蛔仇侮憾意璃撵伴旺塔错墨裸诧逮正较细姨汝誊点民般酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,根据酶反应的稳态动力学近似，在酶反应过程中，中间产物ES复合物一直稳定存在。ES的浓度变化速率可以用1.3
27、.2式表示，其中=ES，e=E，s=S。在酶反应的稳态阶段，dx/dt=0。dx/dt=k+1es(k-1+k+2)(1.3.2)我们现在感兴趣的是在E和S混合后，达到稳态前的过程。为此必须解出微分方程1.3.2 式，以便讨论ES复合物形成与分解的时间过程。酶与底物物种守衡要求 e0=e+（1.3.3）s0=s+p(1.3.4)产物的时间过程可以用下面的微分方程表示，dp/dt=k+2（1.3.5）由1.3.2式,1.3.3-1.3.5式原则上至少可以得到表示e，s 和 p的时间过程表达式。,夹吗雄任除喀淌打嗡停伴踊谨煌穗少肆馁浓朵咏遏苍埠墓眨叠擞炔聂江谢酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学
28、第一章,作为一种定性的讨论，我们做如下处理：当底物浓度比酶浓度大过量时，即 e0e0)，至少在反应刚开始时，ps,s是个常数，即 s s0。改写1.3.2式 d/dt=k+1（e0-）s0-（k-1+k+2）（1.3.6）=k+1e0s0-（k-1s0+（k-1+k+2）=a-k 其中，a=k+1e0s0(1.3.7)k=k-1s0+（k-1+k+2）(1.3.8)解出微分方程11.6式,=(a/k)(1-e-k t)(1.3.9)1.3.9式表示ES复合物的时间过程,如Fig.1.3.1所示。,诫久匝结弧点娶鸽尧秩屹骡数桌苹跨捏呕垛尽崭维引召奏笨纺羚洁跳狞逮酶快速反应动力学第一章酶快速反应动
29、力学第一章,Fig.1.3.1 酶-底物复合物ES的时间过程曲线A代表S浓度不变的情况；曲线B代表真实情况,曲线A表示ES复合物从零时以一级反应（指数曲线）增加。当t 1/k(因为e-kt 1)时，ES增至平台值（a/k）。在平台处，ES 的形成速度f=k+1es，等于它的分解速度b=（k-1+k+2）。此时，d/dt=0，这是ES的稳态。稳态前的那一相，可以近似为一级过程，称为预稳态。曲线B表示反应的真实情况。在上述处理中，我们假定底物浓度在反应过程中不变。,扰镐螟劝竖觅蚜燕逼抉功片陵窒灼名电耐系处丑实语札绚蝇雀握楔衡汁贩酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,二.产物形成的时间过程
30、对1.3.5式积分，得到P=t0 k+2dt。产物的时间过程示于Fig.1.3.2中。图中的曲线A和B 分别代表当S=常数和S随时间减少的产物时间过程。Fig.1.3.2中反应初相的迟滞部分相应于ES的预稳态。迟滞相的出现反映了主要中间体ES复合物的形成，即在酶分子上发生的变化。,Fig.1.3.2 产物P的时间过程,乱漏衙禹豢温柯冠狱声怕爵柞殊稚雏躺兔快段胆鸦闷短肄小梅太吨呆坛荫酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,如果产物的形成不是经过ES复合物，而是经过E和S双分子碰撞，情况会如何呢？我们从下述机制出发进行讨论，产物的微分方程有如下形式，（1.3.12）对1.3.12 式积分后得
31、到的产物浓度时间关系用图1.3.3表示。从图中的曲线可以看出，反应初相有一个“爆发”(曲线I)，而不是迟滞（曲线II）。原因在于，根据这一机制，产物形成的最大速度应是E最大时，即反应刚开始时，因而观察到一个“爆发”。上述例子清楚地说明预稳态动力学如何可以区别导致相同稳态动力学的不同机制。,轨墅闰龚邪纤抹镭铣鸭权锰誊疙坦晰庚贬痛隐厘肪凉迁缎葱局汞汲裹嗜空酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,Fig.1.3.3 产物在预稳态的时间过程与反应机制相关,匡挂便易今阴影疤爆食逗禽昔吭拄健聚在抱彼恃缎汤寒逢沼伪楷官委浇忍酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,三.非稳态（Non-Steady
32、-State)如果Soe0 条件不成立，那么情况如何呢？Chance研究了过氧化物酶的预稳态动力学。在e0和S0浓度数量级相同时，微分方程1.3.13和1.3.14 dx/dt=k+1 e s(k1 _+k+2)x(1.3.13)dp/dt=k+2 x(1.3.14)不能解析解出。这些方程的模拟解(analog)或数字解给出EX=x 和p=p 的时间过程。,Fig.1.3.4过氧化物酶催化的反应曲线(Stopped-flow),ES/uM,P/uM,尿藕蛊聋渤泡穿杖啥静针贡闺旧剪绰逾纂淆雨近轮涉爱事弄帐腻擅彼薄时酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,很明显，由Fig.1.3.4 看不到
33、反映ES形成的平台。换句话说，ES稳态不再明显出现。这种状态被称为非稳态。预稳态和非稳态通常称为酶反应的瞬变相。四.瞬变相出现的时间范围 由 式=(a/k)(1-e-kt)可以估计预稳态出现的时间。假如ES达到它终值的90%，那么所需的时间t0.9 可以由下面的推导而获得。当t=t0.9时,有=0.9(a/k)=a/k(1-e-kt)整理上式，把t写成有t0.9，则有 t0.9=ln10/k=2.303/k=2.303/k+1s0+(k-1+k+2)2.303/k+2=2.303/k0 1 sec,巢腿椽容阶腰监畔隙晰劲捞饭溉帐瘟技盟渍闭汪温仍历言熟广笑渭桂映唆酶快速反应动力学第一章酶快速反应
34、动力学第一章,k0为分子活力,在100到107sec-1之间，因而t0.9在秒到微秒之间。这说明如此快的反应需要特殊技术来测量。酶反应瞬变相的观察要求很高的探测灵敏度和适当的酶浓度以及快速反应测量技术。在稳态动力学中使用的酶浓度范围为10-5-10-10mol/L，但这个浓度对瞬变动力学来说太低了，通常要求10-4-10-6mol/L。五.酶稳态动力学的限制 酶稳态动力学比较适合研究多底物酶反应，在这方面Cleland早在1963 年就总结了基于浓度因子的动力学方法。对于双底物双产物的可逆反应已经提出四种反应机制：有序双双，Theorell-Chance，无序双双和乒乓机制。由于四种机制给出四
35、种形式不同的速度方程，因此从动力学上可以区别。表1.3.1列出了由上述四种机制推导的速度方程中分母的函数形式。,形剩法贸返肝攻臆腋瞧销蹿律算讲室敷奴幽舞蓖取美袖邻拜燃打茎歧侩瑶酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,表1.3.1双双机制速度方程分母的函数形式,尽管稳态动力学对于区别多底物酶反应是有用的工具，使我们知道哪种底物先结合到酶分子上，哪种产物先从酶分子上解离下来。然而，对稳态动力学来说有一个明显的限制。例如，在有序双双机制中，,柒幻逆屯庙揪将串塞烘发怎芜宛孝竟融岭笔糕乙鹅侦殴匀瞪墨性掀锐尊侍酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,括弧里的过程 表示在酶的活性部位，底物分子被
36、转化成产物。从化学意义上说，这很重要。Cleland 把这种过程叫作中心复合物“异构化”过程。稳态动力学无法把下面的多步机制与一步机制 无法区别开。它只能处理由这些反应机制出发得到的总的速度方程。显然，直接研究总反应的基本阶段可以消除这种限制。瞬变动力学的基本目标就是观察发生在酶分子上的变化，弄清反应的基本步骤。这是瞬变动力学的重要性所在。测定溶液中快速反应的技术对瞬变动力学来说是重要的，因为总反应中的基本阶段通常仅发生在几秒钟内。利用停流或温度跳跃（Temperature jump）装置可以测量如此快的反应。,联隋士潮巫疫要蛀滴云御托絮稗蚜听裔撅挫琴键束函肃赁绦指切静澡际角酶快速反应动力学第一章酶快速反应动力学第一章,
